また、『日本書紀』によると、疫病が蔓延したとき、大物主大神から手厚く祭祀を行うようお告げがあったと書かれています。その際、崇神天皇は神に捧げる御酒を造るために高橋活日（たかはしいくひ）を掌酒（さかびと）に任じました。そして活日は一夜にして美酒を醸して奉納し、たちまち疫病は治まったとされます。

活日活日はいわば杜氏の祖。大神神社の摂社、活日神社では、高橋活日命（たかはしいくひのみこと）として祭られています。古地図ではかつて活日神社を「一夜酒之社」と記していたこともありました。

現在でも近くに酒殿が立っており、そこで醸酒が行われていることからも、歴史が継承されてきたことを感じさせます。

三輪山は古くから「三諸山（みむろやま）」とも呼ばれました。「みむろ（実醪）」は「酒のもと」を意味し、酒の神への信仰からそのように名付けられたとされます。また、三輪山の枕詞は「味酒（うまさけ）」で『万葉集』でも額田王（ぬかたのおおきみ）による「味酒 三輪の山」と続く歌が詠まれています。

また、毎年祈願祭の後には大神神社から全国各地の蔵元に「しるしの杉玉」が授与されます。大神神社のご神木は杉であり、酒の神である大物主大神の神威が宿るとされ、蔵元の軒先に酒ばやし（杉玉）を吊るすようになったのです。

青々とした杉玉は今年も新酒が無事にできたことを知らせる役割もあります。杉玉は1年かけて色が変わり、緑色の杉玉は「新酒」、緑色があせれば「夏酒」、やがて茶色く枯れてくると「ひやおろし」がおいしい時期になったと伝える合図になっています。

神聖な山である三輪山は今でも入山が制限されています。

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