舞鶴が佐世保港（長崎県）や呉港（広島県）、横須賀港（神奈川県）と並ぶ軍港に選ばれた秘密を解く鍵は、舞鶴湾の地形にあります。舞鶴湾はもともと狭い入り江が複雑に入り組んだリアス海岸で、ロシアの大きな戦艦が入ってきづらい「天然の要害」だったのです。

また、湾内の干満差が極めて小さく、四方を400m級の山で囲まれていることから、強風・荒天を避けることができました。つまり、船舶の建造や停泊にも最適な地形だったのです。

しかも湾内に侵入する敵の艦船に対して、左右の山に配置した砲台から狙い撃ちすることができました。太平洋戦争時には、敵戦闘機を撃墜するための防空砲台が五老岳山頂（標高300m）に設けられています。

そんな舞鶴港は太平洋戦争が終わると浦賀（うらが）や佐世保、博多などとともに引揚港に指定され、おもに旧満州や朝鮮半島、旧ソ連からの引揚者を受け入れました。1950年以降は国内で唯一の引揚港となり、1958年までの13年間に66万人以上が舞鶴港から入ったといいます。

こうした歴史を残すため、舞鶴市は1988年、舞鶴港のそばに「舞鶴引揚記念館」を設け、当時の資料も保存・展示しています。1994年には引揚桟橋が復元されました。

舞鶴市内には、現在も砲台や弾薬庫、軍用トンネルなど多くの旧軍事施設の跡が残っています。舞鶴海軍工廠は戦後、民間企業が設備を引き継いで造船業を継続。現在はジャパンマリンユナイテッドが運営する日本海側最大の造船所となっています。

また、赤レンガ造りの海軍倉庫は博物館や展示スペース、レストランに使われるなど、旧軍事施設をうまく活用しています。

舞鶴港から船で約1時間の沖合に位置する冠島（かんむりじま）と、冠島の北東2.5㎞の場所にある沓島（くつじま）は、「京都府の鳥」である海鳥オオミズナギドリの集団営巣地としても知られる無人島です。

オオミズナギドリは、国際自然保護連合が作成したレッドリスト（絶滅のおそれのある野生動物のリスト）で準絶滅危惧種に指定されています。2島は国の鳥獣保護区に指定され、原則は上陸禁止となっています。冠島は島自体が天然記念物です。

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