1617（元和3）年には小堀氏に代わって大名の池田氏が入封し、備中松山藩が成立。この時にはすでに一国一城令が発布された後だったため、新たに城が造られることはありませんでした。もし最初から池田氏が入封していたら、もっと便利な場所に新しい城を築いてそこで政務を行っていたかもしれません。6万5000石の大名である池田氏は家臣も多いため、武家屋敷の整備に着手。商人町の下町や、職人町の鍛冶町も建設されました。

しかし池田氏はわずか2代で断絶となり、水谷（みずのや）氏が入封。城下町の町割や小路が整備され、備中松山の城下町が完成しました。2代藩主・水谷勝宗（かつむね）は、備中松山城を大改修。1681（天和元）年から3年かけて、城を近世城郭として整備しました。現在見られる2層の天守は、このときに改修されたものです。

ところが水谷氏も3代で断絶となり、その後も数年～十数年ごとに城主が交替。1744（延享元）年に入封した板倉氏が、備中松山を治めることになります。7代藩主・板倉勝静（かつきよ）は、井伊直弼に代わって老中筆頭になった人物です。戊辰戦争の際、国元は恭順の意を示したため城下町は攻撃されませんでしたが、勝静が五稜郭まで転戦したため、備中松山藩は朝敵とされました。同名の伊予松山藩が早い段階で恭順したため、新政府は敵対した側の備中松山藩に、藩名の変更を要請。1869（明治2）年に高梁川の名前からとった「高梁藩」に改名したことが、現在の高梁市の由来となっています。

1873（明治6）年の廃城令により、日本国内の城は「軍事利用可能な城」と「軍事利用できない城」に仕分けられました。軍事利用可能な城とされた城は軍の管轄となり司令部などに利用、軍事利用できないとされた城は大蔵省に接収され民間に売却されました。備中松山城は大蔵省管轄となったのですが、その後の経緯がはっきりしません。民間が城を購入する理由の大半は、材木や瓦目当てです。山中にある城を壊して、山麓まで材木を持って降りると採算が合わないなどの理由で、放置されたと考えられています。

荒れ放題になっていた備中松山城に脚光が当たったのは、昭和に入ってから。旧制中学校の教師が備中松山城の調査を行い、「郷土の宝」と発表。地元住民の後押しもあり、1939（昭和14）年には当時の町の予算の1/3程度を当てて城の大修理が行われました。この結果、1941（昭和16）年には国の重要文化財に指定されます。
第二次世界大戦中の空襲により、各地に現存していた城の大半が焼失しました。しかし高梁市には軍需工場もなく備中松山城は山頂にあって目立たなかったため、空襲の攻撃目標になりませんでした。さまざまな要因が重なって、現在私たちは、鎌倉時代から伝わる城の姿を見ることができるのです。

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